Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NME8Q8N427 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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