Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC2Q8N158 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms