Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms