Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKAP1Q86WV1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKAP1Q86WV1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms