Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR7

VSIG10L, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10LQ86VR7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
VSIG10LQ86VR7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG10LQ86VR7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms