Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC29A4Q7RTT9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms