Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTF1AQ7RTS3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms