Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC80Q76M96 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms