Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRIG3Q6UXM1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms