Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC1Q6TDU7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms