Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L2Q6R6M4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms