Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KANK3Q6NY19 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms