Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHEQ5VZ18 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms