Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QL3Q5VWW1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms