Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GARNL3Q5VVW2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms