Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOGA3Q5TF21 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms