Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C1orf220Q5T0J3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C1orf220Q5T0J3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms