Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PHYHD1Q5SRE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms