Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM74A1Q5RGS3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM74A1Q5RGS3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms