Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FFAR4Q5NUL3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms