Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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