Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP55Q53EZ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms