Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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KRTAP21-3Q3LHN1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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KRTAP21-3Q3LHN1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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