Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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GEN1Q17RS7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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