Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HADHQ16836 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HADHQ16836 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HADHQ16836 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HADHQ16836 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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