Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPROQ16827 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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