Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SF1Q15637 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SF1Q15637 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SF1Q15637 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SF1Q15637 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF1Q15637 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF1Q15637 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF1Q15637 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SF1Q15637 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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