Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX1-1Q15270 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKX1-1Q15270 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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