Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPRKQ15262 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRKQ15262 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
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