Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD6Q15008 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD6Q15008 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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