Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NCAPHQ15003 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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