Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFIXQ14938 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms