Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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SEMA3AQ14563 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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SEMA3AQ14563 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3AQ14563 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3AQ14563 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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