Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCARF1Q14162 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCARF1Q14162 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms