Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALCAMQ13740 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms