Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP1A4Q13733 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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