Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF5Q13568 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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