Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC1Q13547 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC1Q13547 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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