Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERINC3Q13530 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERINC3Q13530 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms