Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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SCGB2A2Q13296 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCGB2A2Q13296 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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