Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 516.9■□□□□ 0.39e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.249e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GATAD2B-202ENST00000634401 867 ntTSL 516.26■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 316.21■□□□□ 0.199e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.169e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 514.56□□□□□ -0.089e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 414.5□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-212ENST00000556400 604 ntTSL 214.49□□□□□ -0.099e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.19e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 C1orf174-202ENST00000474140 3499 ntTSL 514.22□□□□□ -0.139e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PPP1R9B-201ENST00000513579 655 ntTSL 314.19□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PRMT7-222ENST00000566708 692 ntTSL 314.06□□□□□ -0.169e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GATAD2B-210ENST00000637331 145 ntTSL 513.97□□□□□ -0.179e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.229e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-204ENST00000414996 1746 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-213ENST00000490732 930 ntTSL 213.37□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.279e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 C1orf174-203ENST00000486765 2517 ntTSL 513.17□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 413.08□□□□□ -0.329e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 AC005381.1-203ENST00000591920 569 ntTSL 512.77□□□□□ -0.379e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PRMT7-223ENST00000567542 3542 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.419e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.449e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-212ENST00000488789 1784 ntTSL 212.23□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PREX1-202ENST00000482556 4682 ntTSL 211.99□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-202ENST00000370105 2159 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.549e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-208ENST00000555275 903 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.559e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 511.34□□□□□ -0.599e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-201ENST00000551597 507 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.619e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 211.06□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-205ENST00000554378 741 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.759e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 AC005381.1-204ENST00000585697 599 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.779e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MTMR14-213ENST00000606184 2966 nt10.18□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-209ENST00000555707 1983 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.819e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.819e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.879e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-208ENST00000477293 969 ntTSL 39.4□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)9.37□□□□□ -0.919e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-210ENST00000556002 1039 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.979e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-204ENST00000554360 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.999e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GATAD2B-207ENST00000634791 642 ntTSL 38.43□□□□□ -1.069e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-215ENST00000498372 894 ntTSL 38.01□□□□□ -1.139e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-216ENST00000545299 546 ntTSL 37.83□□□□□ -1.169e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 C14orf37-203ENST00000554218 572 ntTSL 47.67□□□□□ -1.189e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LRCH3-218ENST00000493726 733 ntTSL 37.55□□□□□ -1.29e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.249e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.279e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 46.99□□□□□ -1.299e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.319e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.319e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-206ENST00000466807 948 ntTSL 36.69□□□□□ -1.349e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-214ENST00000543310 562 ntTSL 46.56□□□□□ -1.369e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.389e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-205ENST00000464270 1047 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.389e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.499e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 PSMA3-AS1-202ENST00000553657 398 ntTSL 35.45□□□□□ -1.549e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-209ENST00000481871 972 ntTSL 55.01□□□□□ -1.619e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 DPH5-207ENST00000476507 524 ntTSL 24.78□□□□□ -1.649e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-207ENST00000539098 598 ntTSL 44.38□□□□□ -1.719e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 POLA1-203ENST00000480125 580 ntTSL 34.37□□□□□ -1.719e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 LARP1-202ENST00000517616 501 ntTSL 54.36□□□□□ -1.719e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-206ENST00000536123 558 ntTSL 44.26□□□□□ -1.739e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 ZNF84-209ENST00000539686 637 ntTSL 33.86□□□□□ -1.799e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GPCPD1-206ENST00000481690 819 ntTSL 322.48■■□□□ 1.197e-12■■■■□ 22
TARDBPQ13148 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.694e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-209ENST00000580557 794 ntTSL 314.17□□□□□ -0.144e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.324e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-206ENST00000579491 692 ntTSL 312.99□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 512.99□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-217ENST00000584129 747 ntTSL 310.28□□□□□ -0.764e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 SLC39A11-214ENST00000583146 532 ntTSL 59.22□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 22
TARDBPQ13148 RPRD1B-202ENST00000449186 591 ntTSL 410.75□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 RPRD1B-208ENST00000618318 567 ntTSL 47.28□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 RPRD1B-207ENST00000614670 659 ntTSL 35.65□□□□□ -1.53e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-217ENST00000560570 2321 ntTSL 210.07□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22
TARDBPQ13148 MEIS2-201ENST00000314177 2775 ntTSL 29.22□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 22
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