Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DUSP4Q13115 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DUSP4Q13115 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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