Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BNIP3Q12983 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms