Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRJQ12913 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRJQ12913 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
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