Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LMAN2Q12907 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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