Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMARCB1Q12824 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SMARCB1Q12824 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCB1Q12824 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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