Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMOD3Q0VAK6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD3Q0VAK6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms