Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIPPLY1Q0D2K3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms