Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PUDPQ08623 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PUDPQ08623 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms