Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL16A1Q07092 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL16A1Q07092 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms